Cell | 染色质激活或抑制正常决定了核小体分离的差异性

2022-02-07 00:21:26 来源:
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核仁内部结构通过有助于或选择性该内部结构的核苷酸可以控制DNA组的功能和巨噬细胞身份应属。这些核仁内部结构中的实际上特定的核酸翻译后润色(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定核苷酸完全就其,并可有助于选择性性染色体内部结构的形成,不良影响DNA的传达。为了在有性生殖时即使如此保持表标准型程序的相容性,要求核仁内部结构的分子不同之处也须要在子代巨噬细胞中的创设。创设各有不同类标准型核仁完全的重要要求因素是核酸PTMs,配要实际上于核酸H3和H4的颈部上。因此,在有性生殖的每一次中的,除了DNA副本,性状核小体也须要重建,并分派到子代巨噬细胞中的。确实,深入研究推断出性状的定格核酸(比如副本依靠的核酸)可能会在副本叉后很快愈来愈进一步组装。各有不同的深入研究小组推断出H3K9me3和H3K27me2/3可通过有性生殖基因突变。然而,这两个核酸润色都是与选择性性核仁内部结构就其。那么,性状中的的核小体,以及它们携带的核酸PTMs否都能基因突变到子代巨噬细胞不尽相同的DNA观众席上呢?来自纽约大学兰戈恩医学中的心的Danny Reinberg研究员课题组在Cell发表深入研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该深入研究推断出在DNA副本时,触发与受选择性核仁周围的核小体分离出来是各有不同的。受选择性核仁内部结构中的的核小领悟被迁走在子代巨噬细胞不尽相同的DNA周围,而触发标准型核仁内部结构中的的核小体的分派则是弥散和随机的。为深入研究核小体的分离出来上述情况,深入研究成果在候选DNA观众席都将标明核酸H3.1和H3.2,以小鼠受精小鼠中的核小体在有性生殖时的变化。简单来说,该方式通过邻近蛋白标明技术,运用CRISPR为特定DNA观众席的H3.1和H3.2带上酪氨酸标明,经ChIP-qPCR监测该酪氨酸标明在巨噬基因表达G1期和S期的原子量,以反应核小体的分离出来上述情况。若该碱基H3.1和H3.2上的酪氨酸标明在一次有性生殖后回升一半,所述该核小体被迁走在了两个子代巨噬细胞的不尽相同DNA观众席上;若该酪氨酸润色再一消亡,所述子代巨噬细胞未能基因突变该DNA观众席的核小体。深入研究成果首先监测了在受精小鼠中的噩梦传达的Hoxc6, Ebf1, Meis2DNA的核小体分离出来上述情况。这些DNA观众席的核小体酪氨酸低水平随有性生殖逐渐加倍,这上可能会受选择性的DNA观众席的核小领悟被迁走在子代巨噬细胞的不尽相同位置。这与古人推断出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有性生殖基因突变的现象相印证。那么,触发标准型核仁周围的核小体又是如何分离出来的呢?深入研究成果监测了在受精小鼠中的被触发传达的Ccna2, Nanog和Pou5f1DNA,推断出该DNA观众席的酪氨酸标明在有性生殖后呈弥散完全,原子量较低,这上可能会对于触发标准型核仁周围来说,性状核小体没有简单的分派到子代巨噬细胞除此以外的DNA观众席,而是随机分派的。愈来愈有趣的是,在诱导受精小鼠分化时,Hoxc6DNA由选择性转成触发,它的核小体分派模式也由简单的同碱基分派改为随机分派。这所述性状核小体的角化分派,可以反映该核仁周围的活性完全。总的来说,该深入研究通过CRISPR引导的核酸酪氨酸标明管理系统,深入研究了核小体在有性生殖每一次中的的分式,并推断出触发与受选择性的核仁周围的核小体分式的各有不同。值得注意的是,在巨噬基因表达的S年中的,受选择性的核仁周围的副本要晚于触发标准型核仁周围。这个时间段差相合也避免常可能会核仁的副本运动速度远大于相合核仁。相合核仁一般来说较慢的副本速度似乎前提了核小体的简单分派,而常可能会核仁中的的PTMs则由除此以外的配缓冲突变(master regulators)如此一来辨认除此以外DNA核酸,并招集PTMs蛋白质愈来愈进一步创设。原始出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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